کانن نسخه جدیدی برای نرم افزار داخلی EOS 1000D ارایه کرده است. این نسخه با شماره ۱٫۰٫۶ مشکلی را که منجر به ایجاد خطای ERR99  (به معنی گرفتن عکس امکان پذیر نیست) می‌شود را بر طرف می‌کند. ضمنا مشکلاتی مربوط به نمایشگر LCD دوربین، اطلاعات منظره یاب و عدم عملکرد دکمه شاتر را بر طرف می‌کند. این نرم افزار را می توان از سایت کانن + دانلود کرد.